Перейти к содержанию

PRNP

Эта статья находится на начальном уровне проработки, в одной из её версий выборочно используется текст из источника, распространяемого под свободной лицензией
Материал из энциклопедии Руниверсалис
PRNP

PDB прорисовано на основе 1ag2.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
1E1G, 1E1J, 1E1P, 1E1S, 1E1U, 1E1W, 1FKC, 1FO7, 1H0L, 1HJM, 1HJN, 1I4M, 1OEH, 1OEI, 1QLX, 1QLZ, 1QM0, 1QM1, 1QM2, 1QM3, 2IV4, 2IV5, 2IV6, 2K1D, 2KUN, 2LBG, 2LEJ, 2LFT, 2LSB, 2LV1, 2M8T, 2OL9, 2W9E, 3HAF, 3HAK, 3HEQ, 3HER, 3HES, 3HJ5, 3HJX, 3MD4, 3MD5, 3NHC, 3NHD, 3NVF, 4DGI, 4E1H, 4E1I, 4KML, 4N9O
Идентификаторы
СимволPRNP ; ASCR; AltPrP; CD230; CJD; GSS; KURU; PRIP; PrP; PrP27-30; PrP33-35C; PrPc; p27-30
Внешние IDOMIM: 176640 MGI97769 HomoloGene7904 ChEMBL: 4869 GeneCards: PRNP Gene
Генная онтология
Функция copper ion binding

protein binding
microtubule binding
tubulin binding
identical protein binding
ATP-dependent protein binding

chaperone binding
Компонент клетки nucleus

cytoplasm
mitochondrial outer membrane
endoplasmic reticulum
Golgi apparatus
plasma membrane
integral component of membrane
extrinsic component of membrane
anchored component of membrane
membrane raft

extracellular vesicular exosome
Биологический процесс negative regulation of protein phosphorylation

cellular copper ion homeostasis
response to oxidative stress
cell cycle arrest
axon guidance
learning or memory
metabolic process
negative regulation of interferon-gamma production
negative regulation of interleukin-17 production
negative regulation of interleukin-2 production
negative regulation of apoptotic process
negative regulation of sequence-specific DNA binding transcription factor activity
negative regulation of activated T cell proliferation
response to cadmium ion
response to copper ion
negative regulation of T cell receptor signaling pathway
protein homooligomerization

negative regulation of calcineurin-NFAT signaling cascade
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez562119122
EnsemblENSG00000171867ENSMUSG00000079037
UniProtF7VJQ1P04925
RefSeq (мРНК)NM_000311NM_001278256
RefSeq (белок)NP_000302NP_001265185
Локус (UCSC)Chr 20:
4.67 – 4.68 Mb
Chr 2:
131.91 – 131.94 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

PRNP — ген, расположенный на коротком плече 20-й хромосомы. Кодирует нормальный прионный белок (PrPC) и изоформу этого белка — прионный белок PrPSc, связанный с заболеваниями. Пока не ясно, как именно PrPC превращается в PrPSc, как реплицируется PrPSc и почему его накопление вызывает дегенерацию нейронов.

Белок PRNP представляет собой гликопротеин, крепящийся к клеточной мембране. Описаны взаимодействия PRNP с такими белками, как HSP-60, ламининовый рецептор, ламинин, NCAM, Grb2.

Название

PRNP — сокращение от англ. PRioN Protein.

Клиническое значение

Результаты сканирования мозга трёх пациентов с патологией, напоминающей болезнь Крейтцфельдта — Якоба. Пациенты различаются по мутациям гена PRNP: D178N (GAC→AAC) — слева, E200K (GAG→AAG)-129MV — по центру, (ATG→GTG), и M232R — справа. Из статьи Choi et al., 2009.[1]

Описано более 20 мутаций гена, ассоциированных со следующими прионными заболеваниями:

В одном исследовании сообщается, что в популяции туземцев Папуа-Новой Гвинеи, не так давно практиковавших каннибализм и вследствие этого страдавших от эпидемии куру, ген PRNP содержит защитный полиморфизм G127V, не обнаруживаемый в других популяциях на планете, а также не обнаруживаемый у жертв заболевания.[2]

Примечания

  1. Choi B.Y., Kim S.Y., Seo S.Y., An S.S., Kim S., Park S.E., Lee S.H., Choi Y.J., Kim S.J., Kim C.K., Park J.S., Ju Y.R. Mutations at codons 178, 200-129, and 232 contributed to the inherited prion diseases in Korean patients (англ.) // BMC Infect. Dis.[англ.] : journal. — 2009. — Vol. 9. — P. 132. — doi:10.1186/1471-2334-9-132. — PMID 19698114.
  2. Mead S., Whitfield J., Poulter M., Shah P., Uphill J., Campbell T., Al-Dujaily H., Hummerich H., Beck J., Mein C.A., Verzilli C., Whittaker J., Alpers M.P., Collinge J. A Novel Protective Prion Protein Variant that Colocalizes with Kuru Exposure (англ.) // The New England Journal of Medicine : journal. — 2009. — November (vol. 361, no. 21). — P. 2056—2065. — doi:10.1056/NEJMoa0809716. — PMID 19923577.

Литература

  • «Нарушение фолдинга белков в нейродегенеративных заболеваниях: механизмы и терапевтические стратегии». На английском языке. PRNP описан в главе 13, «Заразные губчатые энцефалопатии», стр. 517 Sewell, Robert G.; Simons, Claire. Protein misfolding in neurodegenerative diseases: mechanisms and therapeutic strategies (англ.). — Boca Raton: CRC Press, 2008. — ISBN 0-8493-7310-7.