Перейти к содержанию

TOP2A

Эта статья находится на начальном уровне проработки, в одной из её версий выборочно используется текст из источника, распространяемого под свободной лицензией
Материал из энциклопедии Руниверсалис
Топоизомераза (ДНК) II альфа 170kDa

PDB показано на примере 1zxm.
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
1LWZ, 1ZXM, 1ZXN, 4FM9
Идентификаторы
СимволTOP2A ; TOP2; TP2A
Внешние IDOMIM: 126430 MGI98790 HomoloGene830 ChEMBL: 1806 GeneCards: TOP2A Gene
номер EC5.99.1.3
Генная онтология
Функция magnesium ion binding

DNA binding
chromatin binding
DNA topoisomerase type II (ATP-hydrolyzing) activity
protein kinase C binding
protein binding
ATP binding
protein C-terminus binding
DNA-dependent ATPase activity
drug binding
DNA binding, bending
enzyme binding
protein homodimerization activity
histone deacetylase binding
ubiquitin binding
poly(A) RNA binding

protein heterodimerization activity
Компонент клетки nuclear chromosome

condensed chromosome
nucleus
nucleoplasm
nucleolus
centriole
nucleoid
DNA topoisomerase complex (ATP-hydrolyzing)
viral integration complex

protein complex
Биологический процесс mitotic cell cycle

resolution of meiotic recombination intermediates
sister chromatid segregation
ATP catabolic process
DNA replication
DNA topological change
DNA ligation
DNA unwinding involved in DNA replication
DNA repair
mitotic recombination
cellular response to DNA damage stimulus
chromosome segregation
apoptotic chromosome condensation
embryonic cleavage
positive regulation of apoptotic process
mitotic DNA integrity checkpoint
positive regulation of viral genome replication
positive regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

phosphatidylinositol-mediated signaling
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez715321973
EnsemblENSG00000131747ENSMUSG00000020914
UniProtP11388Q01320
RefSeq (мРНК)NM_001067NM_011623
RefSeq (белок)NP_001058NP_035753
Локус (UCSC)Chr 17:
38.54 – 38.57 Mb
Chr 11:
98.99 – 99.02 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Топоизомераза ДНК 2 альфа  (топоизомераза IIα) — фермент, который контролирует и изменяет топологические состояния ДНК во время транскрипции и репликации. Топоизомераза IIα кодируется у человека геном TOP2A .

Топоизомераза IIα локализуется в ядре и снижает торсионное напряжение, которое возникает во время транскрипции и репликации. Топоизомераза IIα участвует также в таких процессах, как конденсация хромосом, разделение сестринских хроматид. Этот фермент катализирует разрыв, а затем воссоединение двух нитей спирали ДНК, что позволяет нитям пройти сквозь друг друга, изменяя таким образом топологию ДНК. Существует родственный белок, топоизомераза IIβ, который возник в результате дупликации гена. Ген, кодирующий форму альфа, локализуется на хромосоме 17, а ген формы бета локализован на хромосоме 3.

Топоизомераза IIα является мишенью для нескольких противоопухолевых агентов. Некоторые мутации в гене TOP2A связаны с развитием лекарственной устойчивости в раковых клетках при химиотерапии. Снижение активности этого фермента может также играть роль в атаксии телеангиэктазии.[1]

Взаимодействия

Топоизомераза IIα взаимодействует с HDAC1,[2][3] CDC5L,[4] малым убиквитиносвязанным модификатором 1[англ.][5] и P53.[6]

Примечания

  1. Entrez Gene: TOP2A topoisomerase (DNA) II alpha 170kDa.
  2. Tsai, S C; Valkov N; Yang W M; Gump J; Sullivan D; Seto E. Histone deacetylase interacts directly with DNA topoisomerase II (англ.) // Nat. Genet. : journal. — UNITED STATES, 2000. — November (vol. 26, no. 3). — P. 349—353. — ISSN 1061-4036. — doi:10.1038/81671. — PMID 11062478.
  3. Johnson, C A; Padget K; Austin C A; Turner B M. Deacetylase activity associates with topoisomerase II and is necessary for etoposide-induced apoptosis (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — United States, 2001. — February (vol. 276, no. 7). — P. 4539—4542. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.C000824200. — PMID 11136718.
  4. Ajuh, P; Kuster B; Panov K; Zomerdijk J C; Mann M; Lamond A I. Functional analysis of the human CDC5L complex and identification of its components by mass spectrometry (англ.) // EMBO J.[англ.] : journal. — ENGLAND, 2000. — December (vol. 19, no. 23). — P. 6569—6581. — ISSN 0261-4189. — doi:10.1093/emboj/19.23.6569. — PMID 11101529.
  5. Mao, Y; Desai S D; Liu L F. SUMO-1 conjugation to human DNA topoisomerase II isozymes (англ.) // J. Biol. Chem. : journal. — UNITED STATES, 2000. — August (vol. 275, no. 34). — P. 26066—26073. — ISSN 0021-9258. — doi:10.1074/jbc.M001831200. — PMID 10862613.
  6. Cowell, I G; Okorokov A L; Cutts S A; Padget K; Bell M; Milner J; Austin C A. Human topoisomerase IIalpha and IIbeta interact with the C-terminal region of p53 (англ.) // Exp. Cell Res.[англ.] : journal. — UNITED STATES, 2000. — February (vol. 255, no. 1). — P. 86—94. — ISSN 0014-4827. — doi:10.1006/excr.1999.4772. — PMID 10666337.

Литература

  • Watt P.M., Hickson I.D. Structure and function of type II DNA topoisomerases. (англ.) // Biochem. J.[англ.] : journal. — 1994. — Vol. 303, no. 3. — P. 681—695. — PMID 7980433.
  • Bronner C., Hopfner R., Mousli M. Transcriptional regulation of the human topoisomerase IIalpha gene. (англ.) // Anticancer Res.[англ.] : journal. — 2002. — Vol. 22, no. 2A. — P. 605—612. — PMID 12014628.
  • Järvinen T.A., Liu E.T. Topoisomerase IIalpha gene (TOP2A) amplification and deletion in cancer--more common than anticipated. (англ.) // Cytopathology : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 6. — P. 309—313. — doi:10.1046/j.0956-5507.2003.00105.x. — PMID 14632727.