Перейти к содержанию

SUDS3

Эта статья находится на начальном уровне проработки, в одной из её версий выборочно используется текст из источника, распространяемого под свободной лицензией
Материал из энциклопедии Руниверсалис
Гомолог супрессора дефектного сайленсинга 3 (S. cerevisiae)
Идентификаторы
СимволSUDS3 ; SAP45; SDS3
Внешние IDOMIM: 608250 MGI1919204 HomoloGene15906 GeneCards: SUDS3 Gene
Генная онтология
Функция histone deacetylase activity

protein binding
enzyme binding
protein homodimerization activity

histone deacetylase binding
Компонент клетки nucleus

nucleolus
cytoplasm
plasma membrane

Sin3 complex
Биологический процесс negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter

transcription, DNA-templated
apoptotic process
histone deacetylation
substantia nigra development
positive regulation of apoptotic process

negative regulation of transcription, DNA-templated
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez6442671954
EnsemblENSG00000111707ENSMUSG00000066900
UniProtQ9H7L9Q8BR65
RefSeq (мРНК)NM_022491NM_001122666
RefSeq (белок)NP_071936NP_001116138
Локус (UCSC)Chr 12:
118.81 – 118.86 Mb
Chr 5:
117.09 – 117.12 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Компонент комплексного корепрессора Sin3 гистондеацетилазы SDS3  — фермент, кодируемый у человека геном SUDS3 .[1][2]

SDS3 является субъединицей гистондеацетилазы (см HDAC1; MIM 601241), зависимой от комплексного корепрессора SIN3A (MIM 607776)[2]

Взаимодействия

SUDS3, как было выявлено, взаимодействует с HDAC1,[3][4] HCFC1,[5] SIN3B[1] и SIN3A.[1][4]

Примечания

  1. 1,0 1,1 1,2 Alland L., David G., Shen-Li H., Potes J., Muhle R., Lee H.C., Hou H Jr, Chen K., DePinho R.A. Identification of Mammalian Sds3 as an Integral Component of the Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology[англ.] : journal. — 2002. — March (vol. 22, no. 8). — P. 2743—2750. — doi:10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002. — PMID 11909966.
  2. 2,0 2,1 Entrez Gene: SUDS3 suppressor of defective silencing 3 homolog (S. cerevisiae).
  3. Alland, Leila; David Gregory, Shen-Li Hong, Potes Jason, Muhle Rebecca, Lee Hye-Chun, Hou Harry, Chen Ken, DePinho Ronald A. Identification of Mammalian Sds3 as an Integral Component of the Sin3/Histone Deacetylase Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology[англ.] : journal. — United States, 2002. — April (vol. 22, no. 8). — P. 2743—2750. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.22.8.2743-2750.2002. — PMID 11909966.
  4. 4,0 4,1 Fleischer, Tracey C; Yun Ui Jeong; Ayer Donald E. Identification and Characterization of Three New Components of the mSin3A Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology[англ.] : journal. — United States, 2003. — May (vol. 23, no. 10). — P. 3456—3467. — ISSN 0270-7306. — doi:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. — PMID 12724404.
  5. Wysocka, Joanna; Myers Michael P; Laherty Carol D; Eisenman Robert N; Herr Winship. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes & Development : journal. — United States, 2003. — April (vol. 17, no. 7). — P. 896—911. — ISSN 0890-9369. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868.

Литература

  • Olsen JV; Blagoev B; Gnad F; Macek, Boris; Kumar, Chanchal; Mortensen, Peter; Mann, Matthias. Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks (англ.) // Cell : journal. — Cell Press, 2006. — Vol. 127, no. 3. — P. 635—648. — doi:10.1016/j.cell.2006.09.026. — PMID 17081983.
  • Gerhard DS; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, CM; Grouse, LH; Schuler, G; Klein, SL; Old, S; Rasooly, R. The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC) (англ.) // Genome Research[англ.] : journal. — 2004. — Vol. 14, no. 10B. — P. 2121—2127. — doi:10.1101/gr.2596504. — PMID 15489334.
  • Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, Ai; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki. Complete sequencing and characterization of 21,243 full-length human cDNAs (англ.) // Nature Genetics : journal. — 2004. — Vol. 36, no. 1. — P. 40—5. — doi:10.1038/ng1285. — PMID 14702039.
  • Fleischer T.C., Yun U.J., Ayer D.E. Identification and Characterization of Three New Components of the mSin3A Corepressor Complex (англ.) // Molecular and Cellular Biology[англ.] : journal. — 2003. — Vol. 23, no. 10. — P. 3456—3467. — doi:10.1128/MCB.23.10.3456-3467.2003. — PMID 12724404.
  • Wysocka J; Myers MP; Laherty CD; Eisenman, RN; Herr, W. Human Sin3 deacetylase and trithorax-related Set1/Ash2 histone H3-K4 methyltransferase are tethered together selectively by the cell-proliferation factor HCF-1 (англ.) // Genes & Development : journal. — 2003. — Vol. 17, no. 7. — P. 896—911. — doi:10.1101/gad.252103. — PMID 12670868.
  • Strausberg RL; Feingold EA; Grouse LH; Derge, JG; Klausner, RD; Collins, FS; Wagner, L; Shenmen, CM; Schuler, G.D. Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences (англ.) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. — 2003. — Vol. 99, no. 26. — P. 16899—16903. — doi:10.1073/pnas.242603899. — PMID 12477932.
  • Hattori A; Okumura K; Nagase T; Kikuno, R; Hirosawa, M; Ohara, O. Characterization of long cDNA clones from human adult spleen (англ.) // DNA Research[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 7, no. 6. — P. 357—366. — doi:10.1093/dnares/7.6.357. — PMID 11214971.