5,8S рРНК
Рибосомная РНК 5,8S (5,8S рРНК) — некодирующий компонент РНК большой субъединицы эукариотической рибосомы, играющий важную роль в трансляции белка. Он транскрибируется РНК-полимеразой I как часть предшественника 45S, который также содержит 18S и 28S рРНК. Считается, что его функция заключается в транслокации рибосом[1]. Также известно, что он образует ковалентную связь с белком-супрессором опухоли p53[2]. 5,8S рРНК можно использовать в качестве эталонного гена для обнаружения микроРНК[3]. Рибосомная РНК 5,8S используется для лучшего понимания других процессов и путей рРНК в клетке[4].
РРНК 5,8S гомологична 5'-концу большой субъединицы неэукариотической рРНК. У эукариот вставка ITS2 разрушает рРНК большой субъединицы на 5,8S и 28S рРНК[5]. У некоторых мух 5,8 рРНК дополнительно расщепляется на две части[6].
Состав
Структура рРНК L567.5 имеет размер примерно 150 нуклеотидов и состоит из множества свернутых цепей, некоторые из которых считаются одноцепочечными[7]. Эта рибосомная РНК вместе с 28S и 5S рРНК, а также 46 рибосомными белками образует большую субъединицу рибосомы. 5,8S рРНК первоначально транскрибируется вместе с 18S и 28S рРНК в прерибосомной РНК 45S, вместе с ITS 1 и ITS 2 (внутренний транскрибируемый спейсер) и 5' и 3' ETS (внешний транскрибируемый спейсер)[8]. 5,8S рРНК расположена между двумя ITS-областями, причем ITS1 отделяет ее от 18S рРНК в 5' направлении, а ITS2 — от 28S рРНК в 3' направлении. ITS и ETS отщепляются во время созревания рРНК. Это достигается за счет непрерывного пути расщепления, осуществляемого как эндонуклеазой, так и экзонуклеазой, разрезая спейсеры в определенных местах.
Примечания
- ↑ (May 1997) «Role of the 5.8S rRNA in ribosome translocation». Nucleic Acids Research 25 (9): 1788–1794. doi:10.1093/nar/25.9.1788. PMID 9108162.
- ↑ (June 1997) «Cytoplasmic p53 polypeptide is associated with ribosomes». Molecular and Cellular Biology 17 (6): 3146–3154. doi:10.1128/MCB.17.6.3146. PMID 9154813.
- ↑ (October 2005) «Facile means for quantifying microRNA expression by real-time PCR». BioTechniques 39 (4): 519–525. doi:10.2144/000112010. PMID 16235564.
- ↑ (June 1984) «The ribosomal 5.8S RNA: eukaryotic adaptation or processing variant?». Canadian Journal of Biochemistry and Cell Biology 62 (6): 311–320. doi:10.1139/o84-044. PMID 6380683.
- ↑ Lafontaine (2001). «The function and synthesis of ribosomes». Nature Reviews Molecular Cell Biology 2 (7): 514–520. doi:10.1038/35080045. PMID 11433365.
- ↑ Shimada (August 1992). «Distribution of split 5.8S ribosomal RNA in Diptera». Insect Molecular Biology 1 (1): 45–48. doi:10.1111/j.1365-2583.1993.tb00076.x. PMID 1343775.
- ↑ (June 1983) «5.8S ribosomal RNA». Cell 33 (2): 320–322. doi:10.1016/0092-8674(83)90413-0. PMID 6861202.
- ↑ (27 Oct 2014) «An overview of pre-ribosomal RNA processing in eukaryotes». Wiley Interdisciplinary Reviews: RNA 6 (2): 225–242. doi:10.1002/wrna.1269. PMID 25346433.