Перейти к содержанию

Шаблон:GNF Protein box/doc

Материал из энциклопедии Руниверсалис

Задать вопросы по поводу данного шаблона можно на странице обсуждение.

Перенос шаблона

В английской википедии каждый шаблон GNF Protein box вынесен в отдельную подстраницу. Что бы получить доступ к полному коду шаблону, нажмите на букву E (edit) в нижним правом углу шаблона и скопируйте полученный текст.

Использование

Для того, чтобы использовать данный шаблон, скопируйте нижеприведенный текст и вставьте в начале Вашей статьи. Заполните максимально возможное количество полей, но не беспокойтесь, если некоторые поля останутся пустыми. Для примера того, как может быть заполнен шаблон, перейдите на страницу Лактоферрин. 

{{GNF_Protein_box
| Name = 
| image = 
| image_source = 
| PDB =  
| HGNCid = 
| MGIid = 
| Symbol = 
| AltSymbols = 
| OMIM = 
| ECnumber = 
| Homologene = 
| GeneAtlas_image = 
| Function = 
| NotAProtein = 
| Orthologs =
| Hs_EntrezGene =
| Hs_Ensembl =
| Hs_RefseqmRNA =
| Hs_RefseqProtein =
| Hs_GenLoc_db =
| Hs_GenLoc_chr = 
| Hs_GenLoc_start =
| Hs_GenLoc_end =
| Hs_Uniprot =
| Mm_EntrezGene = 
| Mm_Ensembl = 
| Mm_RefseqmRNA = 
| Mm_RefseqProtein = 
| Mm_GenLoc_db = mm9
| Mm_GenLoc_chr = 
| Mm_GenLoc_start = 
| Mm_GenLoc_end = 
| Mm_Uniprot = 
| path =
| IUPHAR =
}}

Категории

Шаблон автоматически включает в статьях категорию Категория:Белки по алфавиту, при наличии заполненного параметра ECnumber — категорию Категория:Ферменты по алфавиту, при наличии любого заполненного параметра, начинающегшося на префикс Hs, например Hs_EntrezGene — категорию Категория:Белки человека. Отключить простановку всех категорий можно добавлением параметра nocat c любым значением, например так: |nocat = 1.

Параметры

name

  • В этом поле записывается полное название белка, в идеале номенклатурное название, которое можно найти например тут. Обратите внимание, что есть особое поле symbol.

image

  • В этом поле указывается ссылка на файл, представляющий собой двухмерное изображение трёхмерной структуры белка, в общем случае созданное из файла PDB
  • Если поле image заполнено, следует использовать параметр image_source для того, чтобы обозначить структуру, использованную для генерации изображения, предпочтительно используя шаблон Шаблон:PDB2.

PDB

  • This field is used to display a list of available PDB entries. Enter as a list of PDB templates, e.g., «{{PDB2|1SNX}}, {{PDB2|2ETZ}}»

HGNCid

MGIid

  • В этом поле перечисляются уникальные идентификаторы проекта Mouse Genome Informatics .

Symbol

  • В этом поле вводится официальный номенклатурный символ (аббревиатура) по HGNC. обратите внимание, что существует отдельный параметр Name.


AltSymbols

  • В этом поле перечисляются альтернативные символы белка, используемые в публичных базах данных либо по литературным источникам.

OMIM

  • В этом поле перечисляются уникальные идентификаторы по базе данных Mendelian Inheritance in Man.

ECnumber


Homologene

  • В этом поле перечисляются уникальные идентификаторы по базе данных HomoloGene


GeneAtlas_image#

  • В этом поле вводится название файла профиля экспрессии GeneAtlas, показывающая где именно ген экспрессируется во множестве тканей организма. Замените # на значение от 1 до 3.

Protein_domain_image

  • В этом поле вводится путь к изображению структуры домена белка (необязательный параметр)

Function

Component

  • В этом поле перечисляются места функционирования белкав, в общем случае полученные по en:Gene Ontology. Это поле может быть заполнено как список шаблонов GNF_GO, например «{{GNF_GO|id=GO:0000166}}{{GNF_GO|id=GO:0004715}}»


Process

  • В этом поле перечисляются функции белка, в общем случае полученные по en:Gene Ontology. Это поле может быть заполнено как список шаблонов GNF_GO, например «{{GNF_GO|id=GO:0000166}}{{GNF_GO|id=GO:0004715}}»

Orthologs

  • В этом вводятся видоспецифичные идентификаторы белков других организмов. В этом поле должен использоваться шаблон GNF_Ortholog_box.

Path

  • Если присутствует этот параметр, то внизу шаблона появятся ссылки "смотреть/обсуждать/редактировать", ведущие к данному, конкретному шаблону. В норме шаблон называется "PBB/<entrez id>", где <entrez id> в норме представляет собой Hs_EntrezGene (номер доступа EntrezGene).

IUPHAR

  • При устанвке значения "yes", появится ссылка на страницу International Union of Basic and Clinical Pharmacology, содержащая информацию об этом белке (обычно для рецепторов или ионных каналов).

ChEMBL

  • В этом поле перечисляются уникальны идентификаторы бызы данных ChEMBL.

См. также

Источник — https://xn--h1ajim.xn--p1ai/index.php?title=Шаблон:GNF_Protein_box/doc&oldid=417362