Перейти к содержанию

Тромбин

Эта статья находится на начальном уровне проработки, в одной из её версий выборочно используется текст из источника, распространяемого под свободной лицензией
Материал из энциклопедии Руниверсалис
У этого термина существуют и другие значения, см. Тромбин (значения).
Коагуляционный фактор II (тромбин)

Человеческий тромбин в комплексе с ингибитором (гирудин).[1]
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
1A2C, 1A3B, 1A3E, 1A46, 1A4W, 1A5G, 1A61, 1ABI, 1ABJ, 1AD8, 1AE8, 1AFE, 1AHT, 1AI8, 1AIX, 1AWF, 1AWH, 1AY6, 1B5G, 1B7X, 1BA8, 1BB0, 1BCU, 1BHX, 1BMM, 1BMN, 1BTH, 1C1U, 1C1V, 1C1W, 1C4U, 1C4V, 1C4Y, 1C5L, 1C5N, 1C5O, 1CA8, 1D3D, 1D3P, 1D3Q, 1D3T, 1D4P, 1D6W, 1D9I, 1DE7, 1DIT, 1DM4, 1DOJ, 1DWB, 1DWC, 1DWD, 1DWE, 1DX5, 1E0F, 1EB1, 1EOJ, 1EOL, 1FPC, 1FPH, 1G30, 1G32, 1G37, 1GHV, 1GHW, 1GHX, 1GHY, 1GJ4, 1GJ5, 1H8D, 1H8I, 1HAG, 1HAH, 1HAI, 1HAO, 1HAP, 1HBT, 1HDT, 1HGT, 1HLT, 1HUT, 1HXE, 1HXF, 1IHS, 1IHT, 1JMO, 1JOU, 1JWT, 1K21, 1K22, 1KTS, 1KTT, 1LHC, 1LHD, 1LHE, 1LHF, 1LHG, 1MH0, 1MU6, 1MU8, 1MUE, 1NM6, 1NO9, 1NRN, 1NRO, 1NRP, 1NRQ, 1NRR, 1NRS, 1NT1, 1NU7, 1NU9, 1NY2, 1NZQ, 1O0D, 1O2G, 1O5G, 1OOK, 1OYT, 1P8V, 1PPB, 1QBV, 1QHR, 1QJ1, 1QJ6, 1QJ7, 1QUR, 1RD3, 1RIW, 1SB1, 1SFQ, 1SG8, 1SGI, 1SHH, 1SL3, 1SR5, 1T4U, 1T4V, 1TA2, 1TA6, 1TB6, 1TBZ, 1THP, 1THR, 1THS, 1TMB, 1TMT, 1TMU, 1TOM, 1TQ0, 1TQ7, 1TWX, 1UMA, 1UVS, 1VR1, 1VZQ, 1W7G, 1WAY, 1WBG, 1XM1, 1XMN, 1YPE, 1YPG, 1YPJ, 1YPK, 1YPL, 1YPM, 1Z71, 1Z8I, 1Z8J, 1ZGI, 1ZGV, 1ZRB, 2A0Q, 2A2X, 2A45, 2AFQ, 2ANK, 2ANM, 2B5T, 2BDY, 2BVR, 2BVS, 2BVX, 2BXT, 2BXU, 2C8W, 2C8X, 2C8Y, 2C8Z, 2C90, 2C93, 2CF8, 2CF9, 2CN0, 2FEQ, 2FES, 2GDE, 2GP9, 2H9T, 2HGT, 2HNT, 2HPP, 2HPQ, 2HWL, 2JH0, 2JH5, 2JH6, 2OD3, 2PGB, 2PGQ, 2PKS, 2PW8, 2R2M, 2THF, 2UUF, 2UUJ, 2UUK, 2V3H, 2V3O, 2ZC9, 2ZDA, 2ZDV, 2ZF0, 2ZFF, 2ZFP, 2ZFQ, 2ZFR, 2ZG0, 2ZGB, 2ZGX, 2ZHE, 2ZHF, 2ZHQ, 2ZHW, 2ZI2, 2ZIQ, 2ZNK, 2ZO3, 3B23, 3B9F, 3BEF, 3BEI, 3BF6, 3BIU, 3BIV, 3BV9, 3C1K, 3C27, 3D49, 3DA9, 3DD2, 3DHK, 3DT0, 3DUX, 3E6P, 3EE0, 3EGK, 3EQ0, 3F68, 3GIC, 3GIS, 3HAT, 3HKJ, 3HTC, 3JZ1, 3JZ2, 3K65, 3LDX, 3LU9, 3NXP, 3P17, 3P6Z, 3P70, 3PMH, 3PO1, 3QDZ, 3QGN, 3QLP, 3QTO, 3QTV, 3QWC, 3QX5, 3R3G, 3RLW, 3RLY, 3RM0, 3RM2, 3RML, 3RMM, 3RMN, 3RMO, 3S7H, 3S7K, 3SHA, 3SHC, 3SI3, 3SI4, 3SQE, 3SQH, 3SV2, 3T5F, 3TU7, 3U69, 3U8O, 3U8R, 3U8T, 3U98, 3U9A, 3UTU, 3UWJ, 3VXE, 3VXF, 4AX9, 4AYV, 4AYY, 4AZ2, 4BAH, 4BAK, 4BAM, 4BAN, 4BAO, 4BAQ, 4BOH, 4CH2, 4CH8, 4DIH, 4DII, 4DT7, 4DY7, 4E05, 4E06, 4E7R, 4H6S, 4H6T, 4HFP, 4HFY, 4HTC, 4HZH, 4I7Y, 4LZ1, 4LZ4, 4MLF, 4N3L, 4NZE, 4NZQ, 4O03, 4THN, 5GDS, 7KME, 8KME
Идентификаторы
СимволF2 ; PT; RPRGL2; THPH1
Внешние IDOMIM: 176930 MGI: 88380 HomoloGene: 426 ChEMBL: 204 GeneCards: F2 Gene
номер EC3.4.21.5
Генная онтология
Функция • serine-type endopeptidase activity

• receptor binding
• calcium ion binding
• protein binding
• growth factor activity

• thrombospondin receptor activity
Компонент клетки • extracellular region

• extracellular space
• endoplasmic reticulum lumen
• Golgi lumen
• plasma membrane
• extracellular vesicular exosome

• blood microparticle
Биологический процесс • positive regulation of protein phosphorylation

• proteolysis
• acute-phase response
• cell surface receptor signaling pathway
• multicellular organismal development
• blood coagulation
• blood coagulation, intrinsic pathway
• positive regulation of cell proliferation
• regulation of cell shape
• response to wounding
• negative regulation of platelet activation
• positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
• peptidyl-glutamic acid carboxylation
• platelet activation
• regulation of blood coagulation
• positive regulation of blood coagulation
• positive regulation of cell growth
• positive regulation of collagen biosynthetic process
• fibrinolysis
• post-translational protein modification
• cellular protein metabolic process
• negative regulation of proteolysis
• negative regulation of astrocyte differentiation
• leukocyte migration
• positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol
• cytosolic calcium ion homeostasis
• negative regulation of fibrinolysis
• positive regulation of phospholipase C-activating G-protein coupled receptor signaling pathway

• positive regulation of reactive oxygen species metabolic process
Источники: Amigo / QuickGO
Профиль экспрессии РНК
Больше информации
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez214714061
EnsemblENSG00000180210ENSMUSG00000027249
UniProtP00734P19221
RefSeq (мРНК)NM_000506NM_010168
RefSeq (белок)NP_000497NP_034298
Локус (UCSC)Chr 11:
46.74 – 46.76 Mb		Chr 2:
91.63 – 91.64 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Тромбин (фактор свёртывания II) — сериновая протеаза, важнейший компонент системы свёртывания крови человека и животных. Тромбин относится к ферментам класса гидролаз (КФ 3.4.21.5). Катализирует гидролиз пептидных связей, образованных остатками аргинина и лизина, обладает ограниченной субстратной специфичностью. Главная его функция - превращение фибриногена в фибрин. Он действует также на несколько других факторов свертывания.

Синтез

Тромбин образуется при ферментативном отщеплении двух участков от протромбина активированным фактором X (Xa). Активность фактора Xa существенно повышается при его связывании с активированным фактором V (Va), что приводит к образованию т.н. протромбиназного комплекса. Протромбин синтезируется в печени и подвергается ко-трансляционной модификации в ходе витамин K-зависимой реакции, приводящей к конвертации 10 остатков глутаминовой кислоты (Glu) в гамма-карбоксиглутаминовую кислоту (Gla). В присутствии кальция остатки гамма-карбоксиглутаминовой кислоты обеспечивают связывание протромбина с фосфолипидным бислоем мембраны. Недостаточность витамина K или присутствие антикоагулянта варфарина ингибирует образование гамма-карбоксиглутаминовой кислоты, что замедляет процесс свёртывания крови.

Уровень тромбина в крови постепенно повышается с момента рождения пока не достигнет нормального уровня взрослого человека: с концентрации 0,5 U/мл через 1 день после рождения до 0,9 U/мл в 6-месячном возрасте[2].

Регуляция воспаления

Тромбин, помимо гемостаза, участвует в регуляции процессов воспаления. Его действие реализуется через рецепторы, активируемые протеазами и зависит от концентрации[3].

См.также

Примечания

  1. ↑ PDB 2C93; Howard N., Abell C., Blakemore W., Chessari G., Congreve M., Howard S., Jhoti H., Murray C.W., Seavers L.C., van Montfort R.L. Application of fragment screening and fragment linking to the discovery of novel thrombin inhibitors (англ.) // J. Med. Chem.[англ.] : journal. — 2006. — February (vol. 49, no. 4). — P. 1346—1355. — doi:10.1021/jm050850v. — PMID 16480269.
  2. ↑ Andrew M., Paes B., etal. Development of the human coagulation system in the full-term infant (англ.) // Blood[англ.] : journal. — American Society of Hematology[англ.], 1987. — Vol. 70, no. 1. — P. 165—172. — PMID 3593964.
  3. ↑ Strukova S.M. Thrombin as a regulator of inflammation and reparative processes in tissues (англ.) // Biochemistry (Moscow)[англ.] : journal. — 2001. — Vol. 66, no. 1. — P. 8—18. — ISSN 0006-2979. — doi:10.1023/A:1002869310180. (англ.)


Источник — https://xn--h1ajim.xn--p1ai/index.php?title=Тромбин&oldid=7244533