Перейти к содержанию

Окклюдин

Эта статья находится на начальном уровне проработки, в одной из её версий выборочно используется текст из источника, распространяемого под свободной лицензией
Материал из энциклопедии Руниверсалис
Окклюдин

PDB
Доступные структуры
PDB Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
1WPA, 1XAW, 3G7C
Идентификаторы
СимволOCLN ; BLCPMG; PPP1R115
Внешние IDOMIM: 602876 MGI106183 HomoloGene1905 GeneCards: OCLN Gene
номер EC2.1.1.67
Генная онтология
Функция protein binding

thiopurine S-methyltransferase activity

protein domain specific binding
Компонент клетки cytosol

plasma membrane
cell-cell junction
bicellular tight junction
integral component of membrane
apical plasma membrane
apicolateral plasma membrane
cell junction
endocytic vesicle

cytoplasmic vesicle
Биологический процесс protein complex assembly

apoptotic process
cellular component disassembly involved in execution phase of apoptosis
programmed cell death
methylation
cell-cell junction organization
S-adenosylhomocysteine metabolic process
S-adenosylmethionine metabolic process

bicellular tight junction assembly
Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez10050665818260
EnsemblENSG00000197822ENSMUSG00000021638
UniProtQ16625Q61146
RefSeq (мРНК)NM_001205254NM_008756
RefSeq (белок)NP_001192183NP_032782
Локус (UCSC)Chr 5:
69.49 – 69.56 Mb
Chr 13:
100.5 – 100.55 Mb
Поиск в PubMed[1][2]

Окклюдин — интегральный белок с молекулярной массой 65 кДа, который расположен в плотных контактах и является их главным компонентом наряду с клаудинами[1]. У человека оклюдин кодируется геном OCLN и представляет собой 522-аминокислотный полипептид[2][3].

Впервые этот белок был описан в 1993 году Сёитиро Цукитой[1].

Локализация гена OCLN

Ген OCLN расположен на длинном (q) плече хромосомы 5 в позиции q13.1. Он начинается с 69492292 пары оснований и простирается до 69558104 пары оснований, имея в длину 65813 пар оснований. В результате альтернативного сплайсинга экспрессируются две изоформы[4].

Структура белка

В структуре человека выделяют 9 доменов, разделенных на две группы. Первая группа объединяет 5 доменов, расположенных внутриклеточно и внеклеточно, а вторая группа объединяет 4 трансмембранных домены. Эти 9 доменов следующие:

  • N-концевой домен (66 аминокислот)
  • трансмембранный домен 1 (23 аминокислот)
  • внеклеточная петля 1 (46 аминокислот)
  • трансмембранный домен 2 (25 аминокислот)
  • внутриклеточная петля (10 аминокислот)
  • трансмембранный домен 3 (25 аминокислот)
  • внеклеточный домен 2 (48 аминокислот)
  • трансмембранный домен 4 (22 аминокислот)
  • C-концевой домен (257 аминокислот).

C-концевой домен необходим для правильного создания плотных контактов. Он также взаимодействует с несколькими цитоплазматическими белками в соединительном диске и сигнальными молекулами, ответственными за выживание клеток, а его N-концевой домен участвует в уплотненные плотных контактов. Внеклеточная петля оклюдину участвует в регуляции парацелюлярнои проницаемости, а внеклеточный домен 2 участвует в локализации по плотного контакта.

Функции

Окклюдин является важным для функционирования плотных контактов. Он определяет плотность плотных контактов и играет важную роль в обеспечении барьерной функции.

Примечания

  1. 1,0 1,1 Furuse M., Hirase T., Itoh M., Nagafuchi A., Yonemura S., Tsukita S., Tsukita S. Occludin: a novel integral membrane protein localizing at tight junctions (неопр.) // Journal of Cell Biology[англ.]. — 1993. — Т. 123, № 6 Pt 2. — С. 1777—1788. — doi:10.1083/jcb.123.6.1777. — PMID 8276896.
  2. Ando-Akatsuka Y., Saitou M., Hirase T., Kishi M., Sakakibara A., Itoh M., Yonemura S., Furuse M., Tsukita S. Interspecies diversity of the occludin sequence: cDNA cloning of human, mouse, dog, and rat-kangaroo homologues (англ.) // Journal of Cell Biology[англ.] : journal. — 1996. — May (vol. 133, no. 1). — P. 43—47. — doi:10.1083/jcb.133.1.43. — PMID 8601611.
  3. Entrez Gene: OCLN occludin.
  4. [http://web.archive.org/web/20160512030946/https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/100506658 Архивная копия от 12 мая 2016 на Wayback Machine OCLN occludin [Homo sapiens (human)] - Gene - NCBI]