Dicer

Dicer 1, рибонуклеаза III
Dicer 1, рибонуклеаза III
	; Структура РНКазы IIIb и дцРНК-связывающего домена мыши (Dicer).
Доступные структуры
Доступные структуры
PDB	Поиск ортологов: PDBe, RCSB
Список идентификаторов PDB
Список идентификаторов PDB
	2EB1, 4NGB, 4NGC, 4NGD, 4NGF, 4NGG, 4NH3, 4NH5, 4NH6, 4NHA
Идентификаторы
Символ	DICER1 ; DCR1; Dicer; HERNA; MNG1; RMSE2
Внешние ID	OMIM: 606241 MGI: 2177178 HomoloGene: 13251 GeneCards: DICER1 Gene
номер EC	3.1.26.3
Генная онтология
Генная онтология
Функция	• double-stranded RNA binding; • helicase activity; • ribonuclease III activity; • protein binding; • ATP binding; • miRNA binding; • metal ion binding;
Компонент клетки	• endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment; • cytosol; • RISC complex; • axon; • dendrite; • growth cone;
Биологический процесс	• negative regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • angiogenesis; • post-embryonic development; • zygote asymmetric cell division; • gene expression; • negative regulation of Schwann cell proliferation; • positive regulation of Schwann cell differentiation; • stem cell maintenance; • spinal cord motor neuron differentiation; • nerve development; • olfactory bulb interneuron differentiation; • cerebral cortex development; • lung development; • production of siRNA involved in RNA interference; • targeting of mRNA for destruction involved in RNA interference; • pre-miRNA processing; • hair follicle morphogenesis; • positive regulation of myelination; • peripheral nervous system myelin formation; • embryonic hindlimb morphogenesis; • production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA; • multicellular organism growth; • regulation of viral genome replication; • regulation of neuron differentiation; • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter; • spleen development; • regulation of oligodendrocyte differentiation; • branching morphogenesis of an epithelial tube; • neuron projection morphogenesis; • spindle assembly; • defense response to virus; • regulation of cell cycle; • cardiac muscle cell development; • inner ear receptor cell development; • intestinal epithelial cell development; • regulation of enamel mineralization; • hair follicle cell proliferation; • RNA phosphodiester bond hydrolysis; • RNA phosphodiester bond hydrolysis, endonucleolytic; • positive regulation of miRNA metabolic process;
	Источники: Amigo / QuickGO
Ортологи

Dicer — рибонуклеаза из семейства РНКазы III (RNase III), которая разрезает двуцепочечные молекулы РНК и пре-микроРНК (pre-miRNA) с получением коротких двуцепочечных РНК-фрагментов, называемых малыми интерферирующими РНК (siRNA) и микроРНК (miRNA) соответственно. Данные фрагменты имеют длину приблизительно 20-25 нуклеотидов, обычно с оверхенгом в 2-3 нуклеотида на 3'-конце^[1].

Dicer содержит два домена RNase III и один домен PAZ. Расстояние между этими участками в молекуле определяется длиной и углом соединяющей петли и определяет длину образующейся siRNA. Dicer катализирует первую стадию в процессе РНК-интерференции и инициирует образование RISC (RNA-induced silencing complex), каталитический компонент которого, белок Argonaute, является эндонуклеазой, деградирующей мРНК, комплементарные ведущей цепи siRNA^[2].

См. также

РНК-интерференция

Примечания

↑ ^1,0 ^1,1 Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J. Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer (англ.) // Science : journal. — 2006. — Vol. 311, no. 5758. — P. 195—198. — doi:10.1126/science.1121638. — PMID 16410517.
↑ Jaronczyk K., Carmichael J., Hobman T. Exploring the functions of RNA interference pathway proteins: some functions are more RISCy than others? (англ.) // Biochem J^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 387, no. Pt 3. — P. 561—571. — doi:10.1042/BJ20041822. — PMID 15845026.

[Macrae_2006-1] 1,0 ^1,1 Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J. Structural basis for double-stranded RNA processing by Dicer (англ.) // Science : journal. — 2006. — Vol. 311, no. 5758. — P. 195—198. — doi:10.1126/science.1121638. — PMID 16410517.

[Jaronczyk_2005-2] Jaronczyk K., Carmichael J., Hobman T. Exploring the functions of RNA interference pathway proteins: some functions are more RISCy than others? (англ.) // Biochem J^[англ.] : journal. — 2005. — Vol. 387, no. Pt 3. — P. 561—571. — doi:10.1042/BJ20041822. — PMID 15845026.

[1]

[2]